经过一夜停止不用的水龙头及附近水管中的自来水是静止的，水中的残留微生物会大量繁殖，其中可能就有“军团菌”。1976年，美国一群退伍军人在费城一家旅馆中举行年会。会后一个月，与会者中221人得了一种“怪病”，34人相继死亡。研究证实，其元凶是存在于水龙头和水槽水样中的一种致病微生物—军团菌。医学界后来把这种病命名为“军团病”，患病者若不及时治疗，死亡率可高达25%~30%。
最近20年来，军团病在许多国家暴发、流行，已经引起了医学界的广泛重视。此外，经过一夜停止不动的水，会与金属管壁及水龙头金属腔室产生水化反应，形成金属污染水，这就是早晨第一次放水时往往会见到一些反常现象，比如水色发黄、发白或者发浑的原因。另外，我们的水源大都为地表水，受洗涤剂等有机物污染较大。一些有机化合物会和通入水中的消毒剂———氯气反应生成卤烃化合物，如三氯甲烷。这类物质有潜在的致癌性。在早晨放出的水中，上述安全隐患相对来说比较大。这种水含有对人体有害的物质，不宜饮用，也不宜用来刷牙、漱口，可先放出一脸盆水左右，方可接水使用。
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