首次发生血栓栓塞的病死率很不一致，取决于栓塞的范围和病人原来的心肺功能状态。有明显心肺功能障碍者严重栓塞后的死亡机率高(可能>25%)。原来心肺功能正常者大多不致死亡，除非肺血管床的阻塞超过50%。首次发生的致命性栓塞常在1~2小时内死亡。
未经治疗病人反复栓塞的机会约达50%；其中多达半数可能死亡。抗凝治疗可使复发率降至约5%；其中约20%可能死亡。
