NPC原发于鼻咽，但可上行侵及颅底颅内，下行转移至颈淋巴结或经血行转移至骨、肝、肺等组织器官，临床症状复杂多变。NPC的诊断除了根据临床表现外，尚须借助于影像学、内窥镜，甚至血清学的检查．但最后的确诊依据是组织病理学诊断。
1. 临床症状有鼻堵血涕、耳聋、耳鸣、头痛、面麻反复视。
2. 查体可发现鼻咽部肿物、颈部肿块和颅神经麻痹。
3. 鼻咽镜检查包括间接鼻咽镜和纤维鼻咽镜可见到鼻咽顶后壁、侧壁、后鼻孔、鼻腔后部、咽鼓管及软腭的背面等。
4. 影像学检查，包括X线照片、CT及MRI检查。X线照片常用鼻咽侧位片和颅底片可以了解肿瘤的范围和项底骨破坏情况。CT检查除了显示鼻咽腔内肿瘤部位外还可以显示鼻咽腔外侵犯及颈部淋巴结转移的情况。MRI由于能清楚的显示头颅各层次，可以显示肿瘤与周围组织的关系，确定肿瘤的界线较CT清楚和准确，并可了解脑损伤的情况。
5. 组织清理学诊断，NPC的活组织采集可以经口腔或鼻腔咬取活检，亦可以对颈部淋巴结及其他表浅肿块切除活检。近年来有采用细针穿刺作细胞学检查。
6. 血清EB病毒抗体检测可作为一种辅助诊断方法。
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